Цитата (Fade)
for (int a = 0; a < object.size(); a++) {
object.remove(a);
}
ConcurrentModificationException получите
Цитата (wawe)
for (int i = 0; i < entities.size(); i++) {
Entity e = entities.get(i);
if (e.destroyed) entities.remove(i--);
}
И вы тоже. Но вам еще design error. За метод, который "постоянно вызывается"
Цитата (Fade)
Можно еще явно вызвать сборщик мусора System.gc()
явный вызов сборщика мусор приводит к явным тормозам. Не трогайте его без надобности пожалуйста 
Цитата (wawe)
JavaSE Game Developer
really?
Всем добра 
