Цитата
Короче единственный вариант который я нашел это - написать самому сериализуемый класс "схему" который будет содержать параметры всех объектов...
- на мой взгляд это единственный вариант решения. Работать с PrefabUtils во время исполнения не получатся, ибо этот класс находится в сборке UnityEditor, а типы из этой сборки не могут быть использованы в рантайм, проект просто не скомпилируется. Типы из этой сборки используются исключительно для создания инструментов которые будут использованы только редактором Unity.