Если изучить учебники по сборки линукса, можно создать неплохой дистрибутив, самому написать к нему эксклюзивные пакеты и раннер для своих программ. P.S. с графическим интерфейсом тоже проблем не возникнет, их много.
Есть даже сайты:
http://susestudio.com/
http://reconstructor.org/